Dentro de FUNJOSE contamos con diferentes áreas y cada una realiza tareas distintas. Las áreas son:
Área Técnica: está encargada de los becados actuales, da seguimiento a su labor social y rendimiento académico; son quienes realizan el proceso de selección para las becas.
Área Financiera: está a cargo de la revisión de los ingresos y egresos, emite recibos contables y da seguimiento a los benefactores actuales.
Área Legal: encargada de todas las gestiones legales de la fundación, incluyendo la firma y cumplimiento de contratos de los becados.
Área de Comunicación: maneja las redes sociales, administra la página web y el blog, organiza los eventos de recaudación, y es responsable de la imagen de la fundación.
Área de Voluntarios: está a cargo de las aplicaciones de nuevos voluntarios y maneja la elaboración de planes de crecimiento y capacitación de los mismos.